Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp47Q8BY87 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp47Q8BY87 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp47Q8BY87 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp47Q8BY87 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp47Q8BY87 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp47Q8BY87 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms