Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms