Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
IfneQ80ZF2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms