Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Amigo1Q80ZD8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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