Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NanogQ80Z64 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NanogQ80Z64 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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