Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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