Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms