Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Dsg1cQ7TSF0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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