Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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