Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudcd1Q6PIP5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms