Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms