Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim37Q6PCX9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim37Q6PCX9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim37Q6PCX9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim37Q6PCX9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim37Q6PCX9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim37Q6PCX9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Trim37Q6PCX9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim37Q6PCX9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim37Q6PCX9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim37Q6PCX9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trim37Q6PCX9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim37Q6PCX9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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