Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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