Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PatjQ63ZW7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms