Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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