Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sall3Q62255 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms