Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms