Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mdc1Q5PSV9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mdc1Q5PSV9 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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