Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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