Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Urb1Q571H0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Urb1Q571H0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Urb1Q571H0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Urb1Q571H0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms