Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ankrd53Q3V0J4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms