Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms