Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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