Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atxn7l3bQ3UD01 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms