Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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