Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q3U595 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q3U595 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q3U595 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q3U595 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q3U595 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q3U595 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q3U595 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms