Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms