Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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