Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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