Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3ip1Q149C2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms