Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms