Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms