Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem52bQ0VBF2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188 ms