Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms