Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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NfiaQ02780 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms