Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms