Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms