Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms