Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms