Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cbx1P83917 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cbx1P83917 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cbx1P83917 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cbx1P83917 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cbx1P83917 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cbx1P83917 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cbx1P83917 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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