Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tubg1P83887 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms