Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ptprn2P80560 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptprn2P80560 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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