Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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