Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Acta1P68134 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Acta1P68134 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Acta1P68134 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Acta1P68134 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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