Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lsm6P62313 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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