Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms