Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms