Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms