Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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CdaP56389 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CdaP56389 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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