Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Srp9P49962 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms